Akademik Veri Yönetim Sistemi
Iv. Bitki Koruma Kongresi, Kahramanmaraş, Türkiye, 28 - 30 Haziran 2011, ss.1
Kabaktan ve kavundan izole edilen iki siddetli Kabak sarı mozaik virüs (Zucchini yellow mosaic
virus, ZYMV) izolatlarının (sırasıyla ZYMV-Adana (Ad) ve ZYMV-Ahlat (Ah)) genomik
RNAları üzerinde yer alan kılıf protein (CP) genlerinin tamamı klonlanmıs ve nükleotid dizileri ile
amino asit dizileri belirlenmistir. Her iki ZYMV izolatına ait kılıf protein genlerinin 837
nükleotidden olustugu ve yaklasık 31.2kDa büyüklügündeki kılıf proteinini kodladıgı tespit
edilmistir. Filogenetik agaç nükleik asit dizileri temel alınarak neighbor joining yöntemi ile yüz
tekerrürlü olarak olusturulmustur. ZYMV Türk izolatlarının nükleotide dizileri arasında yüksek
düzeyde homoloji tespit edilmistir (% 97). ZYMV-Ad ve ZYMV-Ah izolatlarının kılıf protein
geni, nükleotid düzeyinde karsılastırıldıgı 23 dünya izolatı ile sırasıyla % 93-98 ve % 94-99
oranında benzerlik göstermistir. Farklı cografik bölgelere ait 23 ZYMV izolatı ile nükleotid
düzeyinde yapılan filogenetik analiz sonucunda ZYMVAd izolatı Orta Dogu (Suriye ve Ürdün)
izolatları ile ZYMV-Ah izolatı ise Uzak Dogu (Kore, Tayvan) izolatları ile gruplanmıstır. ZYMVAh
izolatı kılıf proteini N-ucunun oldukça farklı birsekans yapısına sahip oldugu tespit edilmis
(özellikle 699. nükleotide ile 721. nükleotidler arası) buda ZYMV-Ah izolatının karsılastırıldıgı
diger tüm izolatlardan farklı oldugunu ortaya koymustur. Her iki izolatın kılıf proteinlerinin 279
amino asit rezüdüsünden olustugu tespit edilmistir. _zolatların Potyvirüs cinsine dahil 22 farklı
üyesi ile nükleotid düzeyinde yapılan karsılastırmalı analizinde % 58-70 düzeyinde benzerlik
gösterdigi tespit edilmistir. Kabak fidelerine yapılan mekanik inokulasyon çalısmalarında ZYMVAh
izolatının ZYMV-Ad izolatından daha hızlı simptom olusumuna neden oldugu buda ZYMVAh
izolatının ZYMV-Ad izolatından daha siddetli bir izolat oldugunu ortaya koymustur. (Gen
Bankası ulasım no. JF317296-JF317297 )